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Rendre les calculs scientifiques reproductibles

Résumé d’un article de Matthias Schwab, Martin Karrenbach, and Jon Claerbout

lundi 26 juin 2006, par Minh Ha Duong

Afin de promouvoir la reproductibilité des résultats, ce laboratoire utilise de bonnes pratiques dont je vous fais écho ici. Chaque papier est accompagné d’un petit script permettant les fonctions suivantes :
- make burn détruit les fichiers de résultats, les figures par exemple. Personellement, je nomme cette opération make cleaner. Le standard GNU propose aussi distclean, realclean ...
- make build (ré-)génère les fichiers de résultats.
- make display montre les figures, après avoir invoqué le précédent si besoin évidement.
- make clean détruit tous les fichiers qui ne sont ni des sources, ni des figures.

Making scientific computations reproducible